🟣 Données Search Console louches : 1ere place suite à une 301 qui saute

Bonjour tout le monde,

Je vous explique mon "problème" : suite à des modifications sur un site et à un maj WordPress, j'ai eu des gros changements dans les SERP. Site en langue Fr et En dans le domaine de la location de voiture (Antilles).

Paramétrage initial :
ndd.com/fr/ pour le Fr
ndd.com/en/ pour le EN
301 de / à /fr/ pour gérer le .com (j'avais certains liens sur des gros sites Fr vers le .com)

SERP :
- entre la 5e et 7e place pour les mots clés importants en Fr (gros sites historiques à contenu devant)
- en anglais, dans les choux complets (entre la 3e et 6e page)

Paramétrage après la MAJ WP :
Les dossiers ont sauté, ainsi que la 301 donc tout était renvoyé vers le .com (Le Fr et le En)

Résultats de la Search Console :

FR
Avant : http://www.hostingpics.net/viewer.php?id=837435Capturedecran20160627a171225.png
Après : http://www.hostingpics.net/viewer.php?id=942734Capturedecran20160627a171236.png

EN
Avant : http://www.hostingpics.net/viewer.php?id=378902Capturedecran20160627a171527.png
Après : http://www.hostingpics.net/viewer.php?id=591330Capturedecran20160627a171533.png

Du coup, j'ai du mal à comprendre pourquoi ??
J'ai quelques liens qui pointent vers le .com/ mais de la à aller cherche la 1ere place...

Quelqu'un à une idée ?

Merci d'avance